Según el doctor Conde Gargollo, que fue medico director del balneario durante 25 años "Hemos podido confirmar la excelente calidad de su clima como complemento a la cura crenoterápica".

Baños es partícipe de una climatología en Otoño y Primavera lluviosa, en contraste con el verano de escasas precipitaciones, cálido pero no bochornoso. La media anual es de 13.5ºC.

La privilegiada situación de Baños de Montemayor, en un pequeño valle, hace que su clima sea bastante suave sin los extremos fríos de la Meseta castellana, ni el agobiante calor de las llanuras extremeñas. Los inviernos son suaves y en verano, aún en los días más calurosos (35-38ºC como mucho) las noches son muy agradables con unas temperaturas que nunca superan los 25ºC.